החומצה ההיאלורונית נסבלת היטב על ידי הגוף, אך כמו בכל הליך רפואי, קיים סיכון לתופעות לוואי. תופעות אלה נעות בין תגובות נפוצות, כגון אדמומיות ונפיחות, לבין סיבוכים נדירים מאוד, כמו חסימת כלי דם או תגובה אלרגית. לכן, חשוב שהטיפול יתבצע על ידי רופא מנוסה, המכיר את הסיכונים האפשריים ויודע כיצד להתמודד איתם במקרה הצורך.

תופעות לוואי נפוצות כוללות כאבים קלים באזור ההזרקה, תחושת מתיחה, גירוד, נפיחות בשפתיים (לאחר עיבוי שפתיים) ושטפי דם (המופיעים כסימנים כחולים), הנעלמים בתוך מספר ימים.

תופעות נדירות כוללות הפרעות בזרימת הדם, זיהום באזור ההזרקה או תזוזה של חומר המילוי ויצירת גבשושיות.