כאשר הטיפול מתבצע על ידי רופא מנוסה, הזרקת חומצה היאלורונית לשפתיים היא בטוחה ונחשבת לבעלת מעט תופעות לוואי. עם זאת, כמו בכל טיפול רפואי, לא ניתן לשלול לחלוטין אפשרות של תופעות לוואי או סיבוכים נדירים.

מכיוון שכל הזרקה גורמת לטראומה מינימלית לרקמה, ייתכן שיופיעו נפיחות, אדמומיות, גירוד, רגישות קלה או שטפי דם (סימנים כחולים). תופעות אלו נפוצות וחולפות מעצמן תוך 5–7 ימים. למעוניינים, ניתן להשתמש בתכשירים נוגדי נפיחות כדי להאיץ את תהליך ההחלמה.